브라우저에서 DNA 및 RNA 서열 분석

일반 DNA 또는 RNA 텍스트, > 헤더가 있는 FASTA, 여러 줄 서열을 지원합니다. IUPAC 모호성 코드(R, Y, S, W, K, M, B, D, H, V, N)가 인식됩니다. 공백, 숫자, 헤더는 자동으로 제거됩니다.

650개 이상의 타입 II 제한효소가 포함되어 있으며, 기본적으로 약 80개의 일반 효소가 표시됩니다. "모든 효소"로 전환하면 REBASE 기반의 전체 데이터베이스를 볼 수 있습니다.

SantaLucia(1998) 열역학 매개변수를 사용한 최근접 이웃법으로 계산됩니다. 조건: 올리고 50 nM, Na+ 50 mM, Mg2+ 없음. 일반적인 18–30 nt 프라이머에서 정확도 ±1°C.

헤더의 짧은 서열(< 14 nt)은 Wallace 규칙(2°C·AT + 4°C·GC), 14–50 nt는 GC% 기반 공식을 사용합니다. 긴 서열에는 Tm이 표시되지 않습니다. "프라이머" 탭은 더 정확한 최근접 이웃법을 사용합니다.

6개 프레임 모두(정방향 3개 + 역방향 3개)를 스캔합니다. ORF는 개시 코돈(ATG; 미토콘드리아에서는 ATA/ATT/GTG; 세균에서는 GTG/TTG)부터 가장 가까운 종결 코돈까지의 구간입니다. 최소 길이는 설정 가능합니다.

분석은 브라우저에서 수행됩니다. 저희는 익명의 사용 통계(예: "분석" 클릭 사실과 서열 길이)만 수집하며, 서열 내용 자체는 수집하지 않습니다.