DNA- und RNA-Sequenzen im Browser analysieren

Kostenloser umfassender Nukleotid-Sequenz-Analyzer. DNA oder RNA einfügen, um Reverse Komplement, 6-Frame-Protein-Translation, offene Leserahmen mit alternativen Start-Codons, Restriktions-Stellen-Karte, Primer-Qualitäts-Analyse und Codon-Nutzungs-Statistik zu erhalten. Alles rechnet im Browser.

So analysieren Sie eine DNA-Sequenz

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Sequenz eingeben

DNA oder RNA einfügen, FASTA-Datei ins Textfeld ziehen oder per FASTA-Button laden. Sequenzen bis 1.000.000 nt werden unterstützt.

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Ergebnisse erkunden

Tabs wechseln für Reverse Komplement, Translation, ORFs, Restriktions-Stellen, Primer-Check und Codon-Nutzung. Jeder Tab aktualisiert sich sofort.

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Ergebnisse exportieren

Jeden Block in die Zwischenablage kopieren, Sequenz als FASTA herunterladen oder Restriktions-Karte als CSV speichern.

In 6 Frames translatieren, ORFs finden, Restriktions-Stellen kartieren und Primer prüfen

Funktionen

6-Frame-Translation und ORF-Finder 650+ Restriktions-Enzyme Primer-Qualitäts-Check Sequenz-Statistik

Häufige Fragen

Welche Sequenz-Formate werden unterstützt?

Plain DNA/RNA-Text, FASTA mit >-Headern und mehrzeilige Sequenzen. IUPAC-Ambiguitäts-Codes (R, Y, S, W, K, M, B, D, H, V, N) werden erkannt. Leerzeichen, Zahlen und Header werden automatisch entfernt.

Welche Restriktions-Enzyme sind enthalten?

Über 650 Typ-II-Restriktions-Enzyme mit Erkennungs- und Schnitt-Stellen. Standard sind die ~80 am häufigsten genutzten (EcoRI, BamHI, HindIII, NotI, XhoI, SalI und Co.); auf „Alle Enzyme" wechseln für die vollständige REBASE-basierte Datenbank mit seltenen Isoschizomeren.

Wie wird die Primer-Tm berechnet?

Per Nearest-Neighbor-Thermodynamik mit SantaLucia-(1998)-Parametern. Bedingungen: 50 nM Oligo, 50 mM Na⁺, 0 mM Mg²⁺. Genauigkeit ±1 °C für typische 18–30-nt-Primer.

Warum unterscheidet sich die Header-Tm von der Primer-Tm?

Der Header nutzt Wallace (2 °C·AT + 4 °C·GC) für kurz (< 14 nt) und eine GC-%-Formel für 14–50 nt; längere Sequenzen ohne Tm. Der Primer-Tab nutzt das genauere Nearest-Neighbor-Verfahren.

Wie werden ORFs gefunden?

Alle 6 Frames (3 vorwärts + 3 Reverse Komplement) werden gescannt. Ein ORF reicht von einem Start-Codon (ATG; mitochondrial auch ATA/ATT/GTG; bakteriell auch GTG/TTG) bis zum nächsten Stopp. Minimal-Länge ist einstellbar.

Wie funktioniert die Analyse?

Die Sequenz-Analyse läuft im Browser per JavaScript — das Tool parst FASTA-Eingaben, translatiert Codons und kartiert Restriktions-Stellen in Echtzeit.

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Veröffentlicht Aktualisiert