Анализ ДНК и РНК последовательностей в браузере

Бесплатный комплексный анализатор нуклеотидных последовательностей. Вставьте ДНК или РНК — получите обратный комплемент, трансляцию во всех 6 рамках, открытые рамки считывания с альтернативными старт-кодонами, карту сайтов рестрикции, оценку праймеров и статистику кодонов. Расчёты выполняются в вашем браузере.

Как анализировать ДНК последовательность

1
Введите последовательность

Вставьте ДНК или РНК, перетащите FASTA-файл в текстовое поле или загрузите его кнопкой. Поддерживаются последовательности до 1 000 000 нуклеотидов.

2
Изучите результаты

Переключайтесь между вкладками: обратный комплемент, трансляция, ORF, рестрикция, праймеры, кодоны. Каждая вкладка пересчитывается мгновенно.

3
Экспортируйте результаты

Копируйте любую часть результата в буфер обмена или скачивайте последовательность в FASTA, а карту рестрикции — в CSV.

Транслируйте в 6 рамках, ищите ORF, картируйте рестрикцию и проверяйте праймеры

Особенности

Трансляция в 6 рамках и поиск ORF База 650+ рестрикционных ферментов Проверка качества праймеров Статистика последовательности
Понравился сайт? Хотите чтобы он развивался дальше? Поддержите развитие нашего проекта — это вернется Вам добром. Нам нужна Ваша поддержка! Отблагодарить

Частые вопросы

Какие форматы поддерживаются?

Простой текст ДНК или РНК, FASTA с заголовками >, многострочные последовательности. Распознаются коды неоднозначности IUPAC (R, Y, S, W, K, M, B, D, H, V, N). Пробелы, числа и заголовки удаляются автоматически.

Какие ферменты включены в карту рестрикции?

Более 650 рестриктаз типа II с сайтами узнавания и координатами разрезов. По умолчанию показываются ~80 наиболее используемых (EcoRI, BamHI, HindIII, NotI, XhoI, SalI и др.); переключатель «Все ферменты» открывает полную базу с редкими изошизомерами.

Как рассчитывается Tm праймера?

Методом ближайших соседей (nearest-neighbor) с термодинамическими параметрами SantaLucia (1998). Условия: 50 нМ олигонуклеотида, 50 мМ Na+, без Mg2+. Точность ±1°C для типичных праймеров длиной 18–30 нт.

Чем отличается Tm в шапке от Tm праймера?

В шапке для коротких (< 14 нт) используется правило Wallace (2°C·AT + 4°C·GC), для 14–50 нт — формула на основе GC%. Для длинных последовательностей понятие Tm не указывается. На вкладке «Праймеры» используется более точный nearest-neighbor.

Как находятся ORF?

Сканируются все 6 рамок (3 прямых + 3 обратных). ORF — участок от старт-кодона (ATG; в митохондриях также ATA/ATT/GTG; у бактерий — GTG/TTG) до ближайшего стоп-кодона. Минимальная длина настраивается.

Сохраняется ли последовательность на сервере?

Анализ выполняется в браузере. Мы собираем только обезличенную статистику использования (например, факт нажатия «Анализировать» и длину последовательности) — без самого содержимого.

💡 Хотите, чтобы мы улучшили этот инструмент лично для вас?

Мы можем! И это бесплатно. Просто отправьте нам сообщение с вашим пожеланием. Если хотите обсудить детали — оставьте свою почту, и мы с вами свяжемся. Можно анонимно.

Вам может пригодиться

🧬 Анализ гелей 🔬 Спектрограмма 🔬 Счётчик клеток

Как вы оцениваете этот инструмент?

Спасибо за вашу оценку!
Хотите рассказать подробнее? Оставьте комментарий!
Спасибо! Ваш комментарий появится после модерации.
Опубликовано Обновлено