Analysez les séquences ADN et ARN dans votre navigateur

Un analyseur de séquences nucléotidiques complet et gratuit. Collez de l'ADN ou de l'ARN pour obtenir le complément inverse, la traduction protéique sur 6 cadres, les cadres de lecture ouverts avec codons de départ alternatifs, la carte des sites de restriction, l'analyse qualité des amorces et les statistiques d'usage des codons. Tout le calcul s'effectue dans votre navigateur.

Comment analyser une séquence ADN

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Saisissez votre séquence

Collez de l'ADN ou de l'ARN, déposez un fichier FASTA dans la zone de texte ou chargez-le via le bouton FASTA. Séquences jusqu'à 1 000 000 nt prises en charge.

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Explorez les résultats

Changez d'onglet pour le complément inverse, la traduction, les ORF, les sites de restriction, la vérification d'amorces et l'usage des codons. Chaque onglet se met à jour instantanément.

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Exportez vos résultats

Copiez tout bloc dans le presse-papiers, téléchargez la séquence au format FASTA ou la carte de restriction au format CSV.

Traduisez sur 6 cadres, trouvez les ORF, cartographiez les sites de restriction et vérifiez les amorces

Fonctionnalités

Traduction 6 cadres et recherche d'ORF Plus de 650 enzymes de restriction Contrôle qualité des amorces Statistiques de séquence

FAQ

Quels formats de séquences sont pris en charge ?

Texte ADN/ARN brut, FASTA avec en-têtes >, et séquences sur plusieurs lignes. Les codes d'ambiguïté IUPAC (R, Y, S, W, K, M, B, D, H, V, N) sont reconnus. Espaces, chiffres et en-têtes sont supprimés automatiquement.

Quelles enzymes de restriction sont incluses ?

Plus de 650 enzymes de type II avec sites de reconnaissance et positions de coupure. Par défaut, les ~80 plus courantes sont affichées (EcoRI, BamHI, HindIII, NotI, XhoI, SalI...) ; passez à « Toutes les enzymes » pour la base complète dérivée de REBASE avec les isoschizomères rares.

Comment la Tm de l'amorce est-elle calculée ?

Par la méthode thermodynamique des plus proches voisins avec les paramètres de SantaLucia (1998). Conditions : 50 nM oligo, 50 mM Na+, 0 mM Mg2+. Précision à ±1 °C pour les amorces typiques de 18 à 30 nt.

Pourquoi la Tm de l'en-tête diffère-t-elle de celle de l'amorce ?

L'en-tête utilise Wallace (2 °C·AT + 4 °C·GC) pour les courtes (<14 nt) et une formule basée sur le GC % pour 14–50 nt ; les séquences plus longues n'affichent pas de Tm. L'onglet Amorce utilise la méthode plus précise des plus proches voisins.

Comment les ORF sont-ils trouvés ?

Les 6 cadres (3 directs + 3 du complément inverse) sont scannés. Un ORF s'étend d'un codon de départ (ATG ; mitochondrial aussi ATA/ATT/GTG ; bactérien aussi GTG/TTG) au prochain stop. La longueur minimale est paramétrable.

Comment fonctionne l'analyse ?

L'analyse de séquence s'exécute dans votre navigateur via JavaScript — l'outil parse l'entrée FASTA, traduit les codons et cartographie les sites de restriction en temps réel.

💡 Voulez-vous que nous améliorions cet outil pour vous ?

Nous le pouvons — et c'est gratuit ! Envoyez-nous simplement un message rapide avec votre idée. Si vous voulez en discuter en détail, laissez votre e-mail et nous reviendrons vers vous. Vous pouvez rester anonyme.

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